CDS
Accession Number | TCMCG013C20678 |
gbkey | CDS |
Protein Id | XP_006480823.1 |
Location | complement(join(8073564..8073638,8073811..8073879,8074376..8074453,8074565..8074631,8074798..8074902,8074986..8075524,8075616..8075824,8076796..8077435,8077596..8077647,8077941..8078614,8078740..8078931,8079766..8080488,8080581..8080824,8081214..8081354,8081509..8082722,8084683..8085783,8085939..8085998)) |
Gene | LOC102617693 |
GeneID | 102617693 |
Organism | Citrus sinensis |
Protein
Length | 2060aa |
Molecule type | protein |
Topology | linear |
Data_file_division | PLN |
dblink | BioProject:PRJNA225998 |
db_source | XM_006480760.3 |
Definition | E3 ubiquitin-protein ligase PRT6 isoform X1 [Citrus sinensis] |
EGGNOG-MAPPER Annotation
Sequence
CDS: ATGGAAATCGATTCTCCTCCGGATTTCAGTCCCCCTAAGCCTCGTGATCGAATTGTACGGAGGCTGATAAATATTGGAGTTCCGGAGGAGTTCCTTGATTATTCTGGAATTGTTAATTTTGCGAAGAATGATAAGTCACGGATACCAGAGCTGGTATCTACTATCTTGCCTCCAGATGAGGAGGTGGCAGAAGTTATACAAGATGCCAAGGCCAAGAATAAAAAAGTCTCGGTGGGGCCAAATATGAAAGGGAGATTTCGTGAGAGCATGTTATGGTTACAATGGTTAATGTTTGAGCGTGAACCTGAGAAAGTTTTGAGGAAGCTATCAAAAATTGGGCAGCGTGGTGTTTGTGGGGCTGTTTGGGGAAATAATGATATAGCATATAGGTGCAGGACGTGTGAGCATGACCCGACTTGTGCTATTTGTGTTCCTTGTTTTCAGAATGGGAACCACAAGGAGCATGATTATTCAATAATTTATACTGGTGGTGGATGCTGTGATTGTGGGGATGTCACAGCGTGGAAACGTGAAGGCTTCTGCTCAAGACATAAAGGTGCAGAGCAGATACAACCCCTTCCAGAGAAGTATGCTAACTCAGCTGCACCGGTTCTTGATGCCCTTTTCATTTATTGGGAAAACAAGCTCTCATTGGCAGAATCTGTAGGTCAGGAAAACCCTAGAGCGAGTGATCATGTTGCAGAGCGTAGGAAGCTTGCGAATGAACTGACGTTTGCAGTGGTTGAGATGCTTTTAGAGTTTTGCAAGAATAGTGAGAGTTTGCTCAGTTTTGTTTCCAAGAGGGTGATCTCTGTCATTGGTTTACTGGATATTCTGGTCAGGGCAGAGAGGTTCTCGAGTGATGTGGTTGTCAGGAAACTGCATGAGTTGCTCTTAAAACTGCTGGGAGAACCAATCTTCAAATACGAGTTTGCTAAAGTATTTTTATCTTACTATCCAGTTTTTGTGAAGGATGCTATTAGAGAGCACAGTGATGATACTATAAAGAAGTATCCGCTGCTCTCTACATTCTCTGTGCAAATCTTCACGGTCCCAACTCTGACTCCCCGACTTGTTAAAGAGATGAACCTACTGGAAATGCTCTTGGGATGCTTGAGAGAAATTTTTGATTCTTGTGCTGGAGATGATAGTTGTTTACAGGTTGCAAAGTGGGCAAATTTGTACGAGACCACTAATCGTGTGATTGGAGATATTCGATTTGTTATGAGCCATGCTGCAGTTTCTAAATATGCGACGCATGAGCAGTTAAATATCTCAAAAGCTTGGATGAAACTCCTAACATTTGTGCAAGGAATGAACCCTCAGAAGAGGGAAACTGGCATCCATATAAGAGAAGAAAATGAGTATATGCATCTACCATTAGTTTTAGATCATTCTATTGCAAATATTCAACCTCTTCTGGTGGACGGAGCATTTTCTTCTGCTGTTGCTGAAGAGACACGTTATGATTTTAGCATGTACAAACAAGATATTGGTGATGGGGACAGCCTAAGGCATGCCAAAGTTGGACGCCTTTCCCAGGAAAGCTCTGTATGTGGTGCGATGGGGAGGAGCAGTTTATCTGCTTCTACATTAAAGGCTGATGATGTCATATTTGATGCTGTTTCTGATGTTTTACTTCCTCATTCTGTAACATGGTTAGCACATGAGTGCTTGAGGGCCATGGAGAATTGGTTGGGAGTCGATGATAGATCTGTTTCTGTTAATGATATATTGTCTCCAAATGCCAGCAGAATTTCAGGTAGTAACTTTGTTGCATTGAAGAAAACATTATCTAAGATTAAAAAAGGTAAGTCAATTTTTAGTAGACTTGCTGGTTCAAGTGAAGTGACAGCTGGTATTCAGGAAAGTGGTGACCTGGATAATGCTACAAGTATGGGGAAGGAGAGTAAAATAACAATCAGTGGTGAAAGAGATACGGCTTCCTGGAGGTCTGCTGGTTTTAATGATAGTGAAATGGAAGGAGAATGTGCCACAGAATTAGATAACTTACATGTTCTGAGTCTGTGTTATTGGCCTGACATAACGTATGATGTTAGCTCACAAGATGTATCTGTTCACATTCCATTACATCGATTACTTTCCTTGATTATACAAAAAGCATTAAGAAGATGTTATGGTGAATCTGCTGCTTCAGAGAGTGCTGATACTGGTGCTGAAAATCCATTATCAGCAGTCTCGTTGGACTTCTTTGGGCATATCCTTGGAGGATGCCACCCATATGGGTTTTCTGCTTTTGTTATGGAGCATCCTCTACGAATTCGGGTATTTTGTGCCCAGGTTCATGCTGGAATGTGGCGGAGGAATGGAGATGCTGCCCTGTCATCTTGTGAGTGGTACCGTGCTGTTCGTTGGTCTGAACAGGGTTTAGAGCTTGATCTGTTTTTGTTGCAGTGCTGTGCTGCATTGGCCCCGGCTGATCTGTATGTCAATAGAATTATAGAGCGCTTTGGGCTGTCAAACTATCTTTCTCTGAATCTTGAACGGCCTAGCGAGTATGAGCCAATTCTGGTTCAGGAGATGCTCACTCTTATCATACAGATACTCCAAGAAAGGCGATTCTGTGGGTTAACAACAGCTGAAAGTTTGAAAAGAGAGTTGGTTCATAGGTTAGCCATTGGAGATGCCACTCATAGTCAATTGGTGAAATCTTTGCCACGTGATCTCTCCAAGTTCGATCAGCTTCAGGAGATTTTGGATGCAGTTGCTATGTACTCACATCCTTCTGGTTTTAATCAGGGTATGTATTCATTGCGATGGTCATATTGGAAAGAACTAGATATTTACCACCCTCGTTGGAGCTCACGAGATTTGCAAGTTGCTGAAGAAAGATACTTGCGTTTTTGTAGTGTCTCTGCATTGACCGCTCAGCTGCCTAGGTGGACAAAGATATATTATCCTCTTGAGAGCATAGCTGGCATAGCTACATGTAAAGTAGTCCTTCAAGTAATTCGTGCGGTGCTATTTTATGCTGTTTTCACTGATAATCCGACTGATTCTCGCGCCCCCTATGGAGTTCTTTTAACTGCATTGCACTTACTTGCATTAGCGTTAGACGTCTGTTTTCAGAAAAAGAAGTCTGGTGATCAGTCATGTGACATTGGAGGTTCAACTCCCATATTAGATTTTGCTAGTGAAGAAATTGCTGAGGGATTAAATAATGGTGCTGGGAAACAAAGCTTGTTGTCACTTCTTGTTTTCTTGATGGGGATGTATAAGAAAGATGGCGCAGACAACTTTCTGGAAGCAGGCAATTGCAATCTTTCTTCTGTGATTGAAAGTTTACTGAAAAAGTTTGCTGAGATTGATTCTAGATGCATGACCAAACTGCAACAACTTGCACCTGAAATTGTCAGTCATTTGTCACAATCTCTTCCAAGAGATGATACTAGTGGATCATTTTCAGCTTCTGATAGTGAGAAACGCAAGGCAAAAGCTCGAGAGAGACAGGCTGCAATATTGGAAAAAATGAAAGCTGAGCAGTTCAAATTTTTGTCAAGCATTAGTTCCAATATAGAAGATGCTCCAAAATCTGCTCCAGAGGTAACTAACTATGATGCTGAACATGTTTCAGAAGAGTCTGTACAAGATGTGTGTGCCCTTTGCCATGATCCTAATTCCAGAACTCCTGTCTCGTACCTGATTCTTCTCCAGAAATCTAGGCTTTTGAGCTTTGTTGACAGAGGTTCCCCATCATGGGATCAAGATCAGTGGTTGGGCAAGGAATGTGGCACTATTAGTGCAAACAACATGGTCAATCAATTTGGGACAAACACTCCTTCTAGTGCTTTGGGAGTAATTTCATCATGTCAGCTGGCCCAAGTTGCTGAGGAAGCAGTCAATCAGTTTGCCTACAATGGGAAACCTGAAGAAGTGAATGCTGTTCTTGAATTTGTTAAGGCTCAGTTCCCTTCGTTGAGAAACATCCCAATACCTTTTACATTCAGCAATGGAAGGAAGTGTACTGCTTCTAGCATGGAGATGTTTGAACAAGATCTTTACTTATCTATTTGCAGAGAAATGCGTAAGAATATGACATATCCAGATTTAATGAAGGAGGATGAAGAATGCTCAGTTGCTGAAGGTGGTTTAAAAAACAGAGGGAATTCTGATTCTTTCTTGCTTGGAAAATATGTAGCTAGTATTTCAAAGGAGATGAGAGAAAATGCTTCGGCTTCTGAAGTTTCTCGTGGTGATAGAATAGCAGCAGAATCTTTGGTTTATGATGGATTTGGCCCCATAGATTGTGATGGAATTCATCTTTCATCCTGTGGACATGCTGTGCATCAGGGATGTTTGGATCGCTATGTTTCATCATTAAAGGAAAGATATAACAGAAGAATTATTTTTGAAGGAGGACATATTGTGGATCCAGATCAGGGGGAATTTCTTTGCCCTGTATGTCGACAATTAGCGAATTCTGTCTTGCCTGCATTGCCATGGGATCTCCAGAGGATTAACGAGCAACCTACTGTTTCTGGTGTTGGTTTGTCGCTAGATTCAAACTCATCATTTACAACGAGGGAAGAGAATACTTCTCTTCAGCTTCAGCAAGCTGTGTCTCTCTTACAATCTGCTTCCAATGTAGTTGGAAAGGCTGATGTAATTGAATCTTTTCCCCTACTGAAGAATGAAATTATGGCGTCAAATGTTGAAGCTGTCTCTCGTCGGATGTGTAAAATGTATTTTCAAAACAAACTGGATAAGTTTTTCGGATCTGCTAGGGTAAACCCCTCATTGATCATGTGGGATGCTCTCAAGTACTCACTCATGTCAATGGAAATTGCTGCTCGTAGCGAAAAGACTTCCACAACACCAATCTACGATGTTAATGCCCTCGATAAGGAACTCAAATCTTCCAGTGGATTTGTGTTGTCCTTACTACTAAAAGTCGTCCAAAGCATGCGAAGTAAGAATTCTCTTCATGTGCTTCAAAGATTTAGAGGTATTCAGCTTTTTGCAGAGTCAATTTGCTCTGGTACTTCCATTGATAATCCTGGTGGCAGATGCAAACGAGGAGGTAATATGTTAAGTATCTTGAAGCATGCTGATGTCGAAGTGTCATATCCTGACATACAGTTTTGGAATCGGGCATCTGATCCGGTCCTTGCTCGTGATCCATTTTCATCATTGATGTGGGTTCTCTTTTGTCTTCCATGCCAATTTATATTATGCAAGGAATCCTTATTATCCCTTGTGCATGTCTTCTATGCTGTGACACTATCTCAGGCAGTATTATCATGTTGTGGGAAACTTCAATCCAAGGTTAATGAGTTAGGTTTTTCCGATAGCCTGATTAGTGACATCTCCAAACTTTTAGGAGAATTTGGTTCTGCTCAGGAGTATTTTGTTTCGAACTACATTGACCCTTCTTGTGATATCAAGGATATGATTCGTAGATTGAGTTTCCCTTACCTACGGAGGTGTGCATTGCTTTGGAAATTACTGAATTCTACTGTCCCACCTCCTTTCTCTGATAGAGATCATGTTTTGGCTCGATCATCTCATGGTATCAGTGACATGATGGATAGCAGTGATGATGCTTTATCAGATCTCAAAGAAATACAGGAAGTGGAAAAAATGTTTAAGATTCCCTCATTGGATGTTATTCTCAAGGACGAAGTGCTACGTTCTTTAGTGTTGAAATGGTTTCATCATTTTTCTAAGGAGTTTGAAGTTCATCGGTTTCAACATGTTTTATACTCCACCCCTGCTGTTCCATTTAAGTTAATGTGTCTACCTCATCTCTACCAGGATCTTTTGCAGAGGTATATAAAACAGTGTTGCTCTGATTGCAAGTCTGTTCTTGATGAACCTGCTTTGTGCCTGTTATGTGGTAGATTATGTTCCCCAAGCTGGAAGCCATGCTGCAGGGAAAGCAGTTGTCAAAGCCATGCAGTGGCCTGTGGTGCTGGTACTGGTGTATTCCTGTTGATCAGGAGAACAACAATTCTGCTTCAACGATGTGCTCGTCAGGCCCCTTGGCCATCTCCATATTTGGATGCATTTGGTGAAGAGGATATTGAGATGCATAGAGGAAAACCATTGTACTTGAATGAAGAACGCTATGCTGCTCTGACGTACATGGTTGCTTCTCATGGCCTCGATCGGAGTTCCAAAGTGCTCAGCCAAACTACCATTGGTGGTTTCTTCTTGGTTTAG |
Protein: MEIDSPPDFSPPKPRDRIVRRLINIGVPEEFLDYSGIVNFAKNDKSRIPELVSTILPPDEEVAEVIQDAKAKNKKVSVGPNMKGRFRESMLWLQWLMFEREPEKVLRKLSKIGQRGVCGAVWGNNDIAYRCRTCEHDPTCAICVPCFQNGNHKEHDYSIIYTGGGCCDCGDVTAWKREGFCSRHKGAEQIQPLPEKYANSAAPVLDALFIYWENKLSLAESVGQENPRASDHVAERRKLANELTFAVVEMLLEFCKNSESLLSFVSKRVISVIGLLDILVRAERFSSDVVVRKLHELLLKLLGEPIFKYEFAKVFLSYYPVFVKDAIREHSDDTIKKYPLLSTFSVQIFTVPTLTPRLVKEMNLLEMLLGCLREIFDSCAGDDSCLQVAKWANLYETTNRVIGDIRFVMSHAAVSKYATHEQLNISKAWMKLLTFVQGMNPQKRETGIHIREENEYMHLPLVLDHSIANIQPLLVDGAFSSAVAEETRYDFSMYKQDIGDGDSLRHAKVGRLSQESSVCGAMGRSSLSASTLKADDVIFDAVSDVLLPHSVTWLAHECLRAMENWLGVDDRSVSVNDILSPNASRISGSNFVALKKTLSKIKKGKSIFSRLAGSSEVTAGIQESGDLDNATSMGKESKITISGERDTASWRSAGFNDSEMEGECATELDNLHVLSLCYWPDITYDVSSQDVSVHIPLHRLLSLIIQKALRRCYGESAASESADTGAENPLSAVSLDFFGHILGGCHPYGFSAFVMEHPLRIRVFCAQVHAGMWRRNGDAALSSCEWYRAVRWSEQGLELDLFLLQCCAALAPADLYVNRIIERFGLSNYLSLNLERPSEYEPILVQEMLTLIIQILQERRFCGLTTAESLKRELVHRLAIGDATHSQLVKSLPRDLSKFDQLQEILDAVAMYSHPSGFNQGMYSLRWSYWKELDIYHPRWSSRDLQVAEERYLRFCSVSALTAQLPRWTKIYYPLESIAGIATCKVVLQVIRAVLFYAVFTDNPTDSRAPYGVLLTALHLLALALDVCFQKKKSGDQSCDIGGSTPILDFASEEIAEGLNNGAGKQSLLSLLVFLMGMYKKDGADNFLEAGNCNLSSVIESLLKKFAEIDSRCMTKLQQLAPEIVSHLSQSLPRDDTSGSFSASDSEKRKAKARERQAAILEKMKAEQFKFLSSISSNIEDAPKSAPEVTNYDAEHVSEESVQDVCALCHDPNSRTPVSYLILLQKSRLLSFVDRGSPSWDQDQWLGKECGTISANNMVNQFGTNTPSSALGVISSCQLAQVAEEAVNQFAYNGKPEEVNAVLEFVKAQFPSLRNIPIPFTFSNGRKCTASSMEMFEQDLYLSICREMRKNMTYPDLMKEDEECSVAEGGLKNRGNSDSFLLGKYVASISKEMRENASASEVSRGDRIAAESLVYDGFGPIDCDGIHLSSCGHAVHQGCLDRYVSSLKERYNRRIIFEGGHIVDPDQGEFLCPVCRQLANSVLPALPWDLQRINEQPTVSGVGLSLDSNSSFTTREENTSLQLQQAVSLLQSASNVVGKADVIESFPLLKNEIMASNVEAVSRRMCKMYFQNKLDKFFGSARVNPSLIMWDALKYSLMSMEIAARSEKTSTTPIYDVNALDKELKSSSGFVLSLLLKVVQSMRSKNSLHVLQRFRGIQLFAESICSGTSIDNPGGRCKRGGNMLSILKHADVEVSYPDIQFWNRASDPVLARDPFSSLMWVLFCLPCQFILCKESLLSLVHVFYAVTLSQAVLSCCGKLQSKVNELGFSDSLISDISKLLGEFGSAQEYFVSNYIDPSCDIKDMIRRLSFPYLRRCALLWKLLNSTVPPPFSDRDHVLARSSHGISDMMDSSDDALSDLKEIQEVEKMFKIPSLDVILKDEVLRSLVLKWFHHFSKEFEVHRFQHVLYSTPAVPFKLMCLPHLYQDLLQRYIKQCCSDCKSVLDEPALCLLCGRLCSPSWKPCCRESSCQSHAVACGAGTGVFLLIRRTTILLQRCARQAPWPSPYLDAFGEEDIEMHRGKPLYLNEERYAALTYMVASHGLDRSSKVLSQTTIGGFFLV |